A jól ismert védelmi módszereken kívül (például tűzfalak, illetve vírus- és kémprogramkereső szoftverek) a program egy átfogó rendszert kínál a PDF-dokumentumok különböző szintű védettségének biztosításához.
A PDF-dokumentumra jelszóbiztonsági sémát alkalmazhat, így a dokumentum megnyitásához jelszóra lesz szükség, illetve további jelszót is beállíthat az engedélyezett és tiltott műveletek megadásához vagy módosításához.
Tanúsítványbiztonsági sémát alkalmazhat a dokumentumra, ezáltal egy megbízható forrásból származó nyilvános kulcs segítségével titkosíthatja azt. Így csak azok a partnerek szüntethetik meg a titkosítást, akik rendelkeznek a megfelelő titkos kulccsal. Az eljárást a Biztonsági tanúsítványok megosztása című témakör ismerteti.
Digitális aláírást használhat a PDF-dokumentumokban, amelyek meghatározzák, hogy mely műveletek engedélyezettek. Még a biztonsági beállításokkal nem rendelkező dokumentumok esetén is legalább egy figyelmeztetés megjelenik, ha az aláírásuk után változtattak azokon. Ellenőrizheti a bejövő PDF-dokumentumok digitális aláírásait, így meggyőződhet arról, hogy egy megbízható forrásból küldte el azokat.
Kihagyást és dokumentumelem-eltávolítást hajthat végre a bizalmas tartalommal bíró dokumentumok bárki számára megtekinthető verziójának létrehozásához.
E-mail csomagot hozhat létre a biztonságos kézbesítés érdekében: kiválaszthatja a borítékoldalt, egy vagy több csatolt PDF-dokumentumot, a csomagra alkalmazott titkosítási módot és a digitális aláírást.
Lásd még: Biztonsági beállítások és Biztonság panel. A jelszavas védelem és a tanúsítványbiztonság titkosítással védi a dokumentumtartalmakat, az aláírások és hitelesített dokumentumok pedig szintén titkosítással biztosítják az aláírás és a hozzá társított adatok védelmét. A rendelkezésre álló titkosítási szintekről részletesen A PDF-verziók című témakörben tájékozódhat.