Comme annotations, les objets dessin peuvent être insérés à l'aide d'un outil de dessin, et sélectionnés à l'aide de ce même outil ou des outils Sélectionner ou Main. Après aplatissement, ces éléments sont supprimés de la liste Commentaires et transformés en objets qui ne peuvent être sélectionnés et modifiés qu'à l'aide de l'outil Modifier.

Pour insérer une pièce jointe sous forme d'annotation, cliquez sur l'outil Pièce jointe ou Pièce jointe audio et cliquez à l'emplacement de votre choix sur la page. Une icône apparaît ; le nom de la pièce jointe et son auteur s'affichent dans une infobulle. Pour ouvrir le fichier, double-cliquez dessus. Les pièces jointes sont répertoriées dans le volet Commentaires et le volet Pièces jointes. Après aplatissement, les pièces jointes sont retirées des listes Commentaires et Pièces jointes. Le fichier ne peut plus être ouvert. Seule l'icône continue d'apparaître à l'endroit où figurait auparavant la pièce jointe.

Disponibles en tant qu'annotations, les zones de texte peuvent être insérées à l'aide de l'outil Zone de texte, et sélectionnées à l'aide de ce même outil ou des outils Sélectionner ou Main. Lors de l'aplatissement, les zones de texte sont supprimées de la liste Commentaires et transformés en objets document qui peuvent encore être lus, mais sélectionnés et modifiés uniquement avec l'outil Modifier.

En tant qu'annotations, les notes sont insérées par l'outil Note. Pour afficher le texte de la note, double-cliquez dessus. Après aplatissement, elles sont retirées de la liste Commentaires et supprimées ; seule l'icône continue d'apparaître à l'endroit où figurait auparavant la note.

En tant qu'annotations, les tampons sont placés en double-cliquant ou en effectuant un glisser-déposer depuis le volet Tampons. Ils peuvent être sélectionnés à l'aide des outils Commentaire ou Main. Après aplatissement, ces tampons sont supprimés de la liste Commentaires et transformés en objets qui restent visibles, mais qui ne peuvent être sélectionnés et modifiés qu'à l'aide de l'outil Modifier un objet. Ce dernier ne permet généralement de sélectionner qu'un seul élément du tampon. Faites un clic droit et sélectionnez Sélectionner un groupe parent pour sélectionner le tampon entier.

Les calques ne sont pas des annotations. Ils sont répertoriés ou créés dans le volet Calques. Après aplatissement dans la boîte de dialogue Aplatir, tous les calques sont fusionnés en un seul, et les opérations d'annulation ne sont plus disponibles. Le volet Calques propose deux commandes : Aplatir les calques et Fusion de calques. L'option Aplatir les calques fusionne tous les calques en un seul, tandis que l'option Fusion de calques vous permet de choisir les calques à fusionner, ainsi que le calque qui recevra les calques fusionnés.

Après aplatissement, les suppressions, les surlignages et autres annotations de texte continuent de s'afficher, mais ne sont plus sélectionnables. Le texte qui avait été inséré comme nouveau texte ou texte de remplacement est perdu ; seul le symbole d'insertion ^ reste pour indiquer où ont été effectuées les insertions.

Après aplatissement, tous les contrôles de formulaire cessent d'être actifs et ne peuvent plus être sélectionnés avec l'outil Main. Ils ne peuvent être sélectionnés et modifiés qu'à l'aide de l'outil Modifier un objet.

Après aplatissement, tout le contenu 3D est supprimé et remplacé par du contenu 2D, lequel ne peut être sélectionné et modifié qu'à l'aide de l'outil Modifier.

Après aplatissement, les films ne sont plus disponibles ; seule l'icône continue d'apparaître à l'endroit où ils figuraient auparavant.

Lorsqu'un fichier à aplatir contient des biffures définitives, l'aplatissement du fichier permet de les conserver. Les rectangles noirs qui masquent le contenu biffé peuvent être sélectionnés et déplacés à l'aide de l'outil Sélectionner un objet, mais le contenu noirci ne peut être ni affiché, ni faire l'objet de recherches. Lorsqu'un fichier à aplatir contient des éléments uniquement marqués pour biffure, l'aplatissement du fichier ne permet pas de conserver la biffure. Les rectangles noirs qui masquent le contenu marqué pour biffure peuvent être sélectionnés et déplacés à l'aide de l'outil Sélectionner. Dans ce cas, le contenu sous-jacent peut être affiché et faire l'objet de recherches.